张东升 副教授
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发布日期:2014-05-27
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张东升 副教授

 

张东升,男,197512月生。博士,水产与生命学院发育生物系副教授,硕士生导师。19987月获得上海师范大学生物学学士学位,20017月获得中科院上海昆虫所动物学硕士学位,2008年从美国美国伊利诺伊大学获得细胞和发育生物学学博士学位,2008-20012年在美国伊利诺伊大学攻读生物信息学硕士学位。

  

教学工作情况

讲授本科必修课程:《生物信息学上机实践》和《基因组学和生物信息学》,选修课程《生物信息学》以及研究生课程《比较基因组学》

  

主要研究方向

通过比较生物学和分子进化生物学等生物信息学手段,从基因组,蛋白质组和分子水平研究水生生物的适应性进化,尤其是它们对温度,盐碱度和水中氧气含量等环境因素的适应。

  

主持和参与的科教项目

[1]抗冻蛋白基因LD4提高鱼类抗寒性能的分子机制研究,(国家自然基金委面上项目,20161 201912月(参与)

[2]寒冷环境下转座子大规模扩张的表观一次调控机制研究(国家自然科学基金委员会项目,20141201712月,参与)

[3]南极持续寒冷环境下鱼类蛋白质组的适应性进化研究(国家自然科学基金委员会项目,20101 201312月,参与)

[4]青藏高原裂腹鱼类遗传种质资源开发及应用研究(国家自然科学基金委员会项目,20121-201612月,参与)

[5]通过转录组和基因组的进化分析研究南极地区鱼类低温环境适应的分子机制(上海海洋大学博士科研启动基金,20161-201712月,主持)

  

业余爱好

观鸟,关注临港新城地区的生态保护,担任上海海洋大学爱鸟协会会长

  

发表的主要论文情况

[1]Dongsheng Zhang#, Mengchao Yu#, Peng Hu#, Sihua Peng, Yimeng Liu,Weiwen Li, Congcong Wang, Shunping He, Wanying Zhai, Qianghua Xu*,Liangbiao Chen*. Genetic adaptation of the Schizothoracine fishes to the phased uplifting of Qinghai-Tibetan plateau, G3: Genes, Genomes, Genetics, 2017,7(4):1267-1276

[2]Mengchao Yu#, Dongsheng Zhang#,Peng Hu, SihuaPeng, Weiwen Li, Shunping He, Wanying Zhai, Qianghua Xu*, Liangbiao Chen*. Divergent adaptation to Qinghai-Tibetan Plateau implicated from transciptome study of Gymnocypris dobula and Schizothorax nukiangensis,Biochemical Systematics and Ecology, 2017, 71: 97-105

[3]Qianghua Xu*, Chi Zhang, Dongsheng Zhang, Huapeng Jiang, Sihua Peng, Yang Liu, Kai Zhao, Congcong Wang, Liangbiao Chen*. Analysis of the erythropoietin of a Tibetan Plateau schizothoracine fish (Gymnocypris dobula) reveals enhanced cytoprotection function in hypoxic environments. BMC Evolutionary Biology, 2016, 16(1): 11

[4]Yimeng Liu, Liangbiao Chen, Dongsheng Zhang*.Complete mitochondrial genome of the Antarctic crocodile icefish, Chionodraco hamatus (Perciformes: Channichthyidae). Mitochondrial DNA Part B: Resources, 2016, 2359(1): 146-147

[5]Yimeng Liu, Min Yang, Tao Zhou, Hu Xing, Liangbiao Chen, Dongsheng Zhang*.Complete mitochondrial genome of the Antarctic cod icefish, Pagothenia borchgrevink (Perciformes:Nototheniidae). Mitochondrial DNA Part B: Resources, 2016, 1(1): 432-433

[6]Qianghua Xu*, Chang Cai, Xingxing Hu, Yun Liu, Yanan Guo, Peng Hu,Zuozhou Chen, Sihua Peng, Dongsheng Zhang, Shouwen Jiang, Zhichao Wu, Jiulin Chan, Liangbiao Chen*. Evolutionary suppression of erythropoiesis via the modulation of TGF-β signalling in an Antarctic icefish. Molecular Ecology, 2015, 24(18): 4664-4678

[7]Dongsheng Zhang, Weiguang Zhou, Chong Yin, Weitao Chen, Rie Ozawa, Lay-Hong Ang, Lavanya Anandan, Toshiro Aigaki, Huey Hing*. Misexpression screen for genes altering the olfactory map in Drosophila. Genesis, 2006, 44(4): 189-201

[8]Guofang Lin, Qingwen Ma, Dongsheng Zhang,Yonglin Zha, Kejian Lou, Jianhua Shen*. Polymorphism of alpha-estrogen receptor and aryl hydrocarbon receptor genes in dementia patients in Shanghai suburb. Acta Pharmacol Sin, 2003, 24(7): 651-656

[9]Dongsheng Zhang, Guofang Lin, Qingwen Ma, Jianhua Shen*. Nonassociation of aryl hydrocarbon receptor genotypes with susceptibility to bladder cancer in Shanghai population. Acta Pharmacol Sin, 2002, 23(2): 188-192

联系方式

地址:水产与生命学院A115

电话:021-61900472

E-maildszhang@shou.edu.cn

  

欢迎有志于生物信息学学习的同学前来联系,我将尽力为每位同学的成才提供力所能及的帮助。

2018年3月更新)