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发布日期:2020-04-28
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张东升 副教授

 





张东升,男,1975年12月,山东省济宁市人,民盟盟员,汉族,硕士研究生导师; 2008年毕业于美国伊利诺伊大学,获得细胞和发育生物学学博士学位;2008-20012年在美国伊利诺伊大学攻读生物信息学硕士学位。2012年入职,现任水生生物系教师。承担课程:本科必修课程:《生物信息学上机实践》和《基因组学和生物信息学》,选修课程《生物信息学》,公共选修课《鸟类生态与鉴赏》以及研究生课程《比较基因组学》。


研究方向:鸟类生物多样性及进化。通过野外调查和序列分析等手段,研究鸟类的生物多样性和基因多样性,探讨鸟类与环境的关系,推动鸟类的生态保护。

承担的社会工作:上海野生动植物保护协会理事

 

主持和参与的科教项目

1. 一个长江小额野生动植物保护基金:“高校-社区-鸟友”鸟类生态保护三方联动复合体系的构建(横向项目,2020年1月-2021年1月,主持)

2. 抗冻蛋白基因LD4提高鱼类抗寒性能的分子机制研究,(国家自然基金委面上项目,2016年1月— 2019年12月(参与)

3. 寒冷环境下转座子大规模扩张的表观一次调控机制研究(国家自然科学基金委员会项目,2014年1月—2017年12月,参与)

4. 南极持续寒冷环境下鱼类蛋白质组的适应性进化研究(国家自然科学基金委员会项目,2010年1月— 2013年12月,参与)

5. 青藏高原裂腹鱼类遗传种质资源开发及应用研究(国家自然科学基金委员会项目,2012年1月-2016年12月,参与)

6. 通过转录组和基因组的进化分析研究南极地区鱼类低温环境适应的分子机制(上海海洋大学博士科研启动基金,2016年1月-2017年12月,主持)

 

发表的主要论文情况

1. 徐茹晖,张卫平,张东升《通过公民科学的方式调查南汇东滩湿地鸟类多样性》,《湿地科学与管理》,2022年,第18 卷 第3 期16-20页。

2. 张笑磊,邓郁,Kai Pflug,张东升,《华东地区发现日本绣眼鸟》《四川动物》2021年40卷1期 115-116页 

3. 胡田伟,王世航,张东升. 线粒体基因组在红血南极鱼和白血南极鱼中的适应性进化. 基因组学与应用生物学,2022年,第40 卷,第11-12 期合刊,第3448-3457页

4. Lu Yao, Xing Hu Zhang D, Evidence for relaxed selection of mitogenome in rapid‑flow cyprinids. Genes Genomics. 2019 Jul;41(7):863-869. doi: 10.1007/s13258-019-00817-7. Epub 2019 Apr 23.

5. Zhang, D., Hu, P., Liu, T., Wang, J., Jiang, S., Xu, Q., & Chen, L. (2018). GC bias lead to increased small amino acids and random coils of proteins in cold-water fishes. BMC Genomics, 19(1), 1–10.

6. Dongsheng Zhang*, Mengchao Yu*,Peng Hu*,Sihua Peng,YimengLiu,Weiwen Li,Congcong Wang,Shunping He,Wanying Zhai,Qianghua Xu ,Liangbiao Chen , Genetic Adaptation of the Schizothoracine Fishes to the Phased Uplifting of Qinghai-TibetanPlateau ,G3 (Bethesda). 2017 Apr 3;7(4):1267-1276. doi: 10.1534/g3.116.038406. (* Co-first author)

7. Mengchao Yu*,DongshengZhang*,Peng Hu,Sihua Peng,Weiwen Li,Shunping He,Wanying Zhai,Qianghua Xu ,Liangbiao Chen , Divergent adaptation to Qinghai-Tibetan Plateau implicated from Transciptome study of Gymnocypris dobula and Schizothorax nukiangensis ,Biochemical Systematics and Ecology 2017 , 71 :97-105 (* Co-first author)

8. LiuY, Chen L, Zhang D *: Completemitochondrial genome of the Antarctic crocodile icefish , Chionodraco hamatus (Perciformes : Channichthyidae ). Mitochondrial DNA 2016, 2359(March). (*Corresponding author)

9. Liu,Y., Yang, M., Zhou, T., Xing, H., Chen, L., and Zhang, D. (2016). Complete mitochondrial genome of the Antarcticcod icefish, Pagothenia borchgrevink(Perciformes: Nototheniidae). Mitochondrial DNA Part B 1, 432-433. 

10. XuQ, Zhang C, Zhang D, Jiang H, PengS, Liu Y, Zhao K, Wang C, Chen L: Analysis of the erythropoietin of a TibetanPlateau schizothoracine fish (Gymnocypris dobula) reveals enhancedcytoprotection function in hypoxic environments. BMC Evolutionary Biology 2016,16(1):11-11.

11. XuQ, Cai C, Hu X, Liu Y, Guo Y, Hu P, Chen Z, Peng S, Zhang D, Jiang S et al: Evolutionary suppression of erythropoiesisvia the modulation of TGF-β signalling in an Antarctic icefish. MolecularEcology 2015, 24(18):4664-4678.

12. Zhang D, Zhou W, Yin C, Chen W, OzawaR, Ang LH, Anandan L, Aigaki T, Hing H: Misexpression screen for genes alteringthe olfactory map in Drosophila. Genesis 2006, 44(4):189-201.

13. LinGF, Ma QW, Zhang DS, Zha YL, Lou KJ,Shen JH: Polymorphism of alpha-estrogen receptor and aryl hydrocarbon receptorgenes in dementia patients in Shanghai suburb. Acta Pharmacol Sin 2003,24(7):651-656.

14. [9]Zhang DS, Lin GF, Ma QW, Shen JH:Nonassociation of aryl hydrocarbon receptor genotypes with susceptibility tobladder cancer in Shanghai population. Acta Pharmacol Sin 2002, 23(2):188-192.

 

 

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