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发布日期:2020-04-27
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张俊芳 教授


张俊芳,女,197611月生山西太原博士,教授,博士生导师。1999年毕业于山西医科大学,获临床医学学士学位;2002年毕业于山西医科大学,获生物化学专业硕士学位;2009年毕业于中国科学院遗传与发育生物学研究所,获得发育生物学专业博士学位20092012年在美国国立卫生研究院、癌症研究所做访问学者。20131月入职上海海洋大学水产与生命学院工作,现任水生生物系教授。研究方向为表观遗传学与环境适应、癌症与表观遗传学。在鱼类寒冷适应的表观遗传学调控机制及癌基因表达的表观遗传学调控机制等研究方向上取得重要进展。研究成果以第一作者或通讯作者发表于Genome ResPNASSignal Transduct Target TherOncogeneJ VirolCell Death & DisFrontiers in Genetics等国际主流期刊,受到国内外同行广泛关注。张俊芳博士是中国水产学会会员、上海市水产学会会员、中国生物化学与分子生物学学会会员。20192020年挂职于上海市农业农村委员会渔业管理处副处长。现任民盟上海海洋大学委员会主任委员、民盟浦东区委高等教育委员会副主任、民盟上海市委委员、浦东新区政协委员。

 

教学工作情况

主讲本科生课程:《基因组学》、水产卓越班全英文《Genetics》、《生物与环境适应》新生研讨课;

主讲研究生课程:《表观遗传学》

 

主要研究方向

表观遗传学与环境适应;癌症与表观遗传学

近年来随着表观遗传学技术及测序技术的快速发展,使研究者能够在全基因组层面了解染色体空间构象、DNA片段间的相互作用、组蛋白修饰状态等对染色体功能及基因表达调控的影响。本课题组应用现代表观遗传学技术、分子生物学技术、细胞生物学等技术方法研究鱼类寒冷适应的表观遗传学调控机制,以及癌基因远端非编码序列的转录调控机制。主要研究方向如下:

[1] 鱼类寒冷适应的表观遗传学调控机制研究。

[2] 基因远端非编码DNA序列转录调控机制的研究。

[3] 鱼类种质(配子、胚胎)冷冻保存技术研究。

 

主持和参与的科教项目

[1] 上海市农业农村委员会,科技兴农创新项目,水产原种冷冻保存新技术研究,2019.12-2022.12,主持。

[2] 国家自然科学基金委,面上项目,81770165, 上游远端DNA序列调控c-myb基因转录的作用机制研究,2018/01-2021/12,参加。

[3] 上海市人力资源和社会保障局,上海市人才发展资金项目,2014572015/01-2017/12,主持。

[4] 国家自然科学基金委员会,面上项目,31372516,鱼类寒冷环境下逆转座子大规模扩增的表观遗传调控机制研究,2014/01-2017/12,主持。

[5] 国家自然科学基金委员会,国际合作与交流项目, 41481330142,第一届中葡海洋科学合作研究专题研讨会,2014/06-2014/12,主持。

[6] 上海市教育委员会,高校特聘教授岗位计划,2013.1-2015.12,主持。

 

发表的主要论文情况

[1] Mengjia Li, Penglei Jiang, Kai Cheng, Zehui Zhang, Shuyu Lan, Xiaoxia Li, Lirong Zhao, Yucheng Wang, Xiang Wang, Jing Chen, Tao Ji, Bingshe Han* , Junfang Zhang, 2021. Regulation of MYB by distal enhancer elements in human myeloid leukemia. Cell Death and Disease. (IF: 9.685) 12: 223.

[2] Tingting Yan, Chaoqin Shen, Penglei Jiang, Chenyang Yu, Fangfang Guo, Xianglong Tian, Xiaoqiang Zhu, Shiyuan Lu,Bingshe Han, Ming Zhong, Jinxian Chen, Qiang Liu, Yingxuan Chen, Junfang Zhang*, Jie Hong*, Haoyan Chen, Jing-Yuan Fang*, 2021. Risk SNP-induced lncRNA-SLCC1 drives colorectal cancer through activating glycolysis signaling. Signal Transduction and Targeted Therapy (IF: 38.104) 6:70. (* Co-corresponding author)

[3] Han B, Luo J, Jiang P, Li Y, Wang Q, Bai Y, Chen J, Wang J and Zhang J, 2020. Inhibition of Embryonic HSP 90 Function Promotes Variation of Cold Tolerance in Zebrafish. Front. Genet. (IF: 4.772) 11: 541944.

[4] Xiangqin Ji, Penglei Jiang, Juntao Luo, Mengjia Li, Yajing Bai, Junfang Zhang*, Bingshe Han*, 2020. Identification and characterization of miRNAs involved in cold acclimation of zebrafish ZF4 cells. PLoS One (IF: 3.752). 15(1): e0226905.

[5] Chen-Yang Yu# , Ji-Xuan Han#, Junfang Zhang#, Penglei Jiang, Jie Hong, Haoyan Chen, Jing-Yuan Fang, 2019. A 16q22.1 variant confers susceptibility to colorectal cancer as a distal regulator of ZFP90, Oncogene (IF: 9.867) 39(6): 1347-1360. (# Co-first author)

[6] Daniel C. Kraushaar, Zuozhou Chen, Qingsong Tang, Kairong Cui, Junfang Zhang*, Keji Zhao*, 2018. The gene repressor complex NuRD interacts with the histone variant H3.3 at promoters of active genes. Genome Research (IF: 9.43828(11): 1646- 1655 (* Co-corresponding author)

[7] Penglei Jiang, Yanwen Hou, Weikang Fu, Xiaofan Tao, Juntao Luo, Hanxu Lu, cheng Xu, Bingshe Han*, Junfang Zhang*, 2018. Characterization of lncRNAs involved in cold acclimation of zebrafish ZF4 cells. PLoS ONE (IF: 3.752) 13(4): e0195468.

[8] Yan Li, Juntao Luo, Qiongqiong Xu, Yanwen Hou, Penglei Jiang, Yutian Sun, Hanxu Lu, Bingshe Han*, Junfang Zhang*, 2018. Characterization of Selenoprotein P cDNA of the Antarctic toothsh Dissostichus mawsoni and its role under cold pressure. Gene. (IF: 3.913) 647:150–156 (* Co-corresponding author)

[9] Zhang, Junfang*, Han, Bingshe, Li, Xiaoxia, Bies, Juraj, Jiang, Penglei, Koller, Richard P, Wolff, Linda. Distal regulation of c-myb expression during IL-6-induced differentiation in murine myeloid progenitor M1 cells. 2016. Cell Death & Dis, (IF: 9.685) 7(9): e2364.

[10] Bingshe Han, Wenhao Li, Zuozhou Chen, Qiongqiong Xu, Juntao Luo, Yingdi Shi, Xiaoxia Li, Xiaonan Yan, Junfang Zhang (2016) Variation of DNA Methylome of Zebrafish Cells under Cold Pressure. PLoS ONE (IF: 3.752) 11(8): e0160358.

[11] Zhang, Junfang, Markus, Jan, Bies, Juraj, Paul, Thomas, Wolff, Linda, 2012.Three murine leukemia virus integration regions within 100 kilobases upstream of c-myb are proximal to the 5’ regulatory region of the gene through DNA looping, Journal of Virology (IF: 6.549), 86(19): 10524~10532.

[12] Junfang Zhang, Cheng Deng, Jianshe Wang, Liangbiao Chen, Identification of a novel two-domain antifreeze protein gene in Antarctic eelpout Lycodichthys dearborni, 2009.Polar Biology, 32(1): 35~40.

[13] Zuozhou Chen#, C.-H. Christina Cheng#, Junfang Zhang#, Lixue Cao, Lei Chen, Longhai Zhou, Yudong Jin, Hua Ye, Cheng Deng, Zhonghua Dai, Qianghua Xu, Peng Hu, Shouhong Sun, Yu Shen, Liangbiao Chen, 2008. Transcriptomic and genomic evolution under constant cold in Antarctic notothenioid fish, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America.105(35): 12944~12949 (# Co-first author)

[14] NL-cheng, J Xie, JF Zhang, BF Yu, XJ Chen, XM Xu, B Niu. High expression of recombinant human Platelet Factor 4 in Escherichia and its bioactivities. 2005. The FEBS Journal. 272(S1): 83.

[15] 杨宇熙,韩兵社,王玉成,张俊芳.HBS1L-MYB基因区域在遗传性血红蛋白疾病中的研究进展[J].生命科学,2022,34(05):581-589.

[16] 张众,李梦佳,韩兵社,张俊芳.JUN调控HeLa细胞抗低温能力的作用研究[J].基因组学与应用生物学,2021,40(Z4):3387-3395.

[17] 燕晓霞,季涛,罗军涛,韩丽洁,陈静,张俊芳,韩兵社.斑马鱼hdac10通过促进自噬提高低温胁迫下的细胞存活[J].基因组学与应用生物学,2022,41(03):482-493.

[18] 季涛,燕晓霞,韩兵社,张俊芳.KDM4A的结构、功能及其在肿瘤中作用的研究进展[J].生命科学,2021,33(06):742-751.

[19] 李飞,罗军涛,燕晓霞,陈静,张婷婷,韩兵社,张俊芳.敲降组蛋白去乙酰化酶HDAC8对斑马鱼ZF4细胞存活率的影响[J].基因组学与应用生物学,2021,40(03):985-990.

[20] 程凯,张众,李梦佳,张泽辉,张俊芳,韩兵社.U937细胞中GATA1调控c-myb基因表达[J].基因组学与应用生物学,2021,40(03):1339-1347.

[21] 富伟康,姜蓬垒,刘玮,韩兵社,张俊芳.Tn5表达与纯化及对ZF4细胞DNA的酶活力测试[J].基因组学与应用生物学,2020,39(10):4487-4490.

[22] 张俊芳,陶筱帆,韩兵社.南极鱼抗冻蛋白功能和进化及其应用研究进展[J].中国水产科学,2020,27(03):355-361.

[23] 李小霞,李双雪,赵丽蓉,兰树雨,张俊芳,韩兵社.小鼠M1细胞中ctcf基因的敲降及其对c-myb基因表达的影响[J].基因组学与应用生物学,2019,38(12):5379-5385.

[24] 刘玮,罗军涛,谢婷婷,燕晓霞,张俊芳,韩兵社.kdm4A在斑马鱼细胞低温胁迫过程中的作用[J].基因组学与应用生物学,2020,39(10):4467-4474.

[25] 陶筱帆,谢婷婷,李小霞,罗军涛,白雅静,韩兵社,张俊芳.低温驯化下斑马鱼LINE1的表达检测[J].渔业科学进展,2020,41(03):88-93.

[26] 兰树雨,程凯,李小霞,姜蓬垒,赵丽蓉,张俊芳,韩兵社.c-myb基因启动子的表观遗传学修饰对c-myb基因表达的影响[J].基因组学与应用生物学,2020,39(09):4108-4115.

[27] 姜蓬垒,时应娣,侯艳雯,韩兵社,张俊芳.低温压力对ZF4细胞组蛋白修饰的影响[J].中国水产科学,2019,26(02):280-286.

[28] 侯艳雯,刘玮,姜蓬垒,张俊芳,韩兵社.低温对斑马鱼ZF4细胞基因组DNA甲基化水平的影响[J].中国水产科学,2019,26(02):271-279.

[29] 赵丽蓉,李小霞,姜蓬垒,兰树雨,张俊芳,韩兵社.c-myb基因启动子表观遗传修饰对该基因表达的影响[J].基因组学与应用生物学,2019,38(09):3973-3980.

[30] 罗军涛,李艳,陶筱帆,刘玮,倪国军,张俊芳,韩兵社.HSP90抑制剂根赤壳菌素对斑马鱼胚胎发育的影响[J].中国水产科学,2017,24(05):988-994.

[31] 时应娣,李晓霞,罗军涛,韩兵社,张俊芳.低温压力下水通道蛋白1b(aqp1b)基因的表达及表观调控[J].基因组学与应用生物学,2017,36(02):595-602.

[32] 许琼琼,韩兵社,罗军涛,李艳,侯艳雯,胡鹏,张俊芳.低温胁迫诱导斑马鱼ZF4细胞ROS及MAPK相关蛋白表达的影响[J].中国水产科学,2016,23(04):771-776.

[33] 王建,张俊芳,韩兵社,张东升.生物专业新生研讨课建设探索[J].求知导刊,2015,(17):68-69.

 

申请和授权专利情况

张俊芳、韩兵社、罗军涛,一种提高鱼类耐受低温能力的技术方法,专利号:ZL201610387001.5

 

科教工作获奖情况

[1] 2021年,获高等学校科学研究优秀成果奖,自然科学奖,一等奖(第7完成人

[2] 2020年,获海洋科学技术奖,一等奖 (第13完成人);

[3] 2019年, “斑马鱼细胞低温适应的表观遗传调控机制研究”获上海海洋大学科技成果三等奖. (第1完成人)

 

联系方式

地址:上海市浦东新区沪城环路999号上海海洋大学水产与生命学院,A111室,邮编:201306

电话:021-61900476

E-mail: jfzhang@shou.edu.cn