胡鹏，博士

国家青年人才计划入选者

上海海洋大学水产与生命学院教授、博士生导师

水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室主任

上海海洋大学青年教师工作委员会主任

地址：上海市浦东新区沪城环路999号海科楼1004（实验室海科楼1018）

邮箱：phu@shou.edu.cn 

学术网页: https://scholar.google.com/citations?hl=en&user=c9x6MQcAAAAJ

ORICD： 0000-0002-0017-1948

实验室网页：www.hulabshou.cn

项目支持

1. 十四五国家重点研发计划青年科学家项目，2023-2027, 200万元；主持

2. 国家自然科学基金生物育种专项，2024-2028， 100万元；主持

3. 国家自然科学基金面上项目，2024-2027， 50万元；主持

4. 国家自然科学基金青年项目，2023-2025，30万元；主持

5. 国家级青年人才计划，2022-2024，200万元；主持

教育和学习经历

中国科学院遗传与发育生物学研究所，中国北京市

· 2009年9月- 2014年1月    理学博士，生物信息学

· 导师：陈良标研究员

中国农业大学，中国北京市

· 2007年9月- 2009年7月    农学硕士，动物遗传育种与繁殖

· 导师：王爱国教授

华中农业大学，中国湖北省武汉市

· 2003年9月- 2007年7月    农学学士，动物科学

工作经历

上海海洋大学，中国上海市

· 2021年12月- 至今          教授、博士生导师, 水产与生命学院

美国宾夕法尼亚大学，美国宾州费城市

· 2016年4月- 2021年12月   博士后, 医学院

· 合作导师：Hao Wu教授

上海海洋大学，中国上海市

· 2014年2月- 2016年4月    博士后, 水产与生命学院

· 合作导师：陈良标教授

研究方向

1. 鱼类功能基因组学

2. 抗病抗逆分子育种

3. 分子生物学技术研发（单细胞多组学、病原快速分子检测等）及应用

学术兼职

1. 上海海洋大学校学术委员会委员，2025/12起

2. 澳门青年科学家协会副会长，2024/08起

3. 《大连海洋大学学报》青年编委，2023/11起

4. 中国水产学会《水产学报》青年编委会，2023/10起

5. 临港新片区海洋生物医药科技创新型平台专家，2024年起

获奖情况

鱼类抗冻蛋白基因的起源和低温适应的分子发育机制研究，2020年教育部高等学校科学研究优秀成果奖（科学技术）一等奖（排名：12/12）

代表性论文（*通讯作者、^#第一作者）

Benchmarking metabolic RNA labeling techniques for high-throughput single-cell RNA sequencing.

Zhang X, Peng M, Zhu J, Zhai X, Wei C, Jiao H, Wu Z, Huang S, Liu M, Li W, Yang W, Miao K, Xu Q, Chen L, Hu P*(通讯)

Nature Communications, 2025, 16(1): 5952.  PMID: 40593761

Avian GCGR-mediated continuous fat utilization offers perspectives for obesity treatment.

Zhang C, Wang X, Feng C, Zheng H, Leng S, Jiang Y, Sun Q, Li X, Zhang T, Zhang J, Chen H, Lai S, Makalowski W, Brosius J, Shi Y, He Y, Hu P*(通讯), Sun Q*, Deng C*. 

Nature Communications, 2025. PMID: 41315395

Single-Cell Transcriptome Profiling Reveals Conserved IFNγ-IL8 Signaling-Induced Antibacterial Neutrophil States During Bacterial Infection.

Zhai X, Zhang M, Li K, Li W, Li X, Gao W, Sun Z, Huang D, Huang S, Liu M, Wu Z, Zou J, Chen L, Yang J*, Hu P*(通讯)

Advanced Science, 2025, e04840. PMID: 40598825

Systematic Enhancer Mapping and Functional Analysis in Zebrafish with Optimized CRISPR Interference.

Chan J, Wu Z, Liu M, Wang T, Liu H, Cao R, Li X, Li X, Zhan S, Cheng J, Xu Y, He M, Feng Y, Xu Q, Sun Y, Chen L*, Hu P*(通讯)

Nucleic Acids Research, 2025, 53(22): gkaf1367. PMID: 41414673

Uncovering the chromatin-mediated transcriptional regulatory network governing cold stress responses in fish immune cells.

Jiao H, Huang S*, Zhang M, Huang Q, Yan C, Qi J, Cheng J, Xu Y, Zhai X, Li X, Zhan S, Li W, Wu Z, Chan J, Chen L*, Hu P*(通讯)

Journal of Genetics and Genomics, 2025, 52(8):1046-1057. PMID: 39848465

Heat inducible nuclear translocation of Kdm6bb drives temperature dependent sex reversal in Nile tilapia.

Lu J, Huang S, Wei S, Cheng J, Li W, Fei Y, Yang J, Hu R, Huang S, Zhai W, Wu Z, Liu M, Xu Q, Hu P* (通讯), Chen L*

PLoS Genetics, 2025, 21(4): e1011664. PMID: 40305565

Chromatin dynamics and transcriptional regulation of heat stress in an ectothermic fish.

Huang S, Yan C, Xu Y, Qi J, Huang Q, Zhang M, Wu Z, Chan J, Liu M, Chen L*, Hu P * (通讯)

Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 2025, 292:20250769. PMID: 40555363

Deletion of hepcidin disrupts iron homeostasis and hematopoiesis in zebrafish embryogenesis.

Yang W, Peng M, Wang Y, Zhang X, Li W, Zhai X, Wu Z, Hu P*(通讯), Chen L*

Development, 2025, 152(7): dev204307.  PMID: 40110772

scGO: interpretable deep neural network for cell status annotation and disease diagnosis.

Wu Y, Xu P, Wang L, Liu S, Hou Y, Lu H, Hu P*(通讯), Li X*, Yu X*

Briefings in Bioinformatics, 2025, 26(1): bbaf018. PMID: 39820437

Joint single-cell profiling resolves 5mC and 5hmC and reveals their distinct gene regulatory effects.

Fabyanic E^#, Hu P^#(共同第一), Qiu Q*, Wang T, Berrios KN, Flournoy J, Connolly DR, Zhou Z, Kohil RM, Wu H

Nature Biotechnology, 2024, 42(6):960-974. PMID: 37640946

A handheld isothermal fluorescence detector for duplex visualization of aquatic pathogens via enhanced one-pot LAMP-PfAgo assay.

Pang F, Zhang T, Dai F, Wang K, Jiao T, Zhang Z, Liu M, Hu P*(通讯), Song J*

Biosensors and Bioelectronics, 2024, 254: 116187. PMID: 38518558

================================= Before SHOU =================================

Neuronal Yin Yang1 in the prefrontal cortex regulates transcriptional and behavioral responses to chronic stress in mice. 

Kwon DY, Xu B^#, Hu P^#(共同第一), Zhao YT, Beagan JA, Nofziger JH, Cui Y, Xu B, Zaitseva D, Phillips-Cremins JE, Blendy JA, Wu H, Zhou Z

Nature Communications, 2022, 13: 55.  PMID: 35013139

Massively parallel and time-resolved single-cell RNA sequencing with scNT-Seq.

Qiu Q^#, Hu P^#(共同第一), Qiu X, Govek KW, Camara PG, Wu H

Nature Methods, 2020, 17(10):991-1001. PMID: 32868927

Single cell transcriptomic analysis of the adult mouse pituitary reveals a novel multi-hormone cell cluster and physiologic demand-induced lineage plasticity.

Ho Y^#, Hu P^#(共同第一), Peel MT, Chen S, Camara PG, Epstein DJ, Wu H, Liebhaber SA

Protein & Cell, 2020, 11(8):565-583.  PMID: 32193873

Single-nucleus transcriptomic survey of cell diversity and functional maturation in postnatal mammalian hearts.

Hu P^#(共同第一), Liu J^#, Zhao J^#, Wilkins BJ, Lupino K, Wu H, Pei L

Genes & Development, 2018, 32(19-20):1344-1357. PMID: 30254108

Dissecting Cell-Type Composition and Activity-Dependent Transcriptional State in Mammalian Brains by Massively Parallel Single-Nucleus RNA-Seq.

Hu P^#(共同第一), Fabyanic E^#, Kwon DY, Tang S, Zhou Z, Wu H

Molecular Cell, 2017, 68(5):1006-1015.e7.  PMID: 29220646

Genetic Adaptation of Schizothoracine Fish to the Phased Uplifting of the Qinghai–Tibetan Plateau.

Zhang D^#, Yu M^#, Hu P^#(共同第一), Peng S, Liu Y, Li W, Wang C, He S, Zhai W, Xu Q, Chen L

G3: Genes|Genomes|Genetics, 2017, 7(4):1267-1276.  PMID: 28209761

Transcriptome comparison reveals a genetic network regulating the lower temperature limit in fish.

Hu P, Liu M, Liu Y, Wang J, Zhang D, Niu H, Jiang S, Wang J, Zhang D, Han B, Xu Q, Chen L

Scientific Reports, 2016, 30:6:28952.  PMID: 27356472

Global identification of the genetic networks and cis-regulatory elements of the cold response in zebrafish.

Hu P, Liu M, Zhang D, Wang J, Niu H, Liu Y, Wu Z, Han B, Zhai W, Shen Y, Chen L

Nucleic Acids Research, 2015, 43(19):9198-213.  PMID: 26227973

受邀国际/国内学术会议

1. “高通量单细胞新生RNA测序技术研发及应用”，云南大学生命科学学院云生命学术讲座，2025年12月，云南昆明.

2. “鱼类早期发育时空基因调控解析：新生RNA与增强子功能研究范式”，上海海洋大学建校113周年校庆学术报告，2025年11月，上海.

3. “Adaptive Evolution of the Icefish: Insights into the Large Heart from Non-Coding Elements”，德国明斯特大学，2025年9月，德国明斯特.

4. “高通量单细胞新生RNA测序技术研发及应用”，中国动物学会斑马鱼分会-飞鱼论坛，2025年7月，线上.

5. “Advancing Transcriptomic and Epigenetic Regulation in Early Fish Embryo Development: Tools for New RNA Synthesis and Enhancer Identification”，2024年国际产学研用会议，2024年12月，湖南长沙.

6. “新型单细胞基因组学技术研发及其在水产动物上应用与探索”，水产遗传育种研讨会暨基因组育种培训会，2024年12月，浙江湖州.

7. “新型单细胞基因组学技术研发及其在心脑疾病中应用”，苏州大学基础医学院前沿讲座，2024年12月，江苏苏州.

8. “新型单细胞基因组学技术研发及其在水产动物中的应用”，中国水产学会水产生物技术与遗传育种专业委员会2024年学术年会，2024年11月，山东青岛.

9. “Adaptive Evolution of the Icefish: Insights into the Large Heart from Non-Coding Elements”，The 5th Annual Meeting International Joint Research Center of Marine Biology, 2024年11月，中国澳门.

10. “新型单细胞基因组学技术研发及其在生物高原适应性进化中的应用探讨”，第二届华西贡嘎国际高原医学论坛暨四川省医学会第四次高原医学学术会议，2024年11月，四川成都.

11. “高通量单细胞新生转录本代谢标记技术开发与应用”，第六届全国斑马鱼PI大会，2024年11月，湖北武汉.

12. “当鱼类生物学遇到新型单细胞组学技术”，上海海洋大学建校112周年校庆学术报告，2024年11月，上海.

13. “当鱼类生物学遇到新型单细胞组学技术”，全国第十二届海洋生物技术创新与转化应用研讨会暨中国生物化学与分子生物学会海洋专业分会年会，2024年11月，上海.

14. “新型单细胞基因组学技术研发及其在水产动物中的应用”，山东省农业科学院舜耕论坛，2024年10月，山东济南.

15. “新型单细胞基因组学技术研发及其在心脑疾病中应用”，中国药科大学学术报告，2024年7月，江苏南京.

16. “新型单细胞基因组学技术研发及其在心脑疾病中应用”，合肥综合性国家科学中心大健康研究院南艳湖讲坛，2024年7月，安徽合肥.

17. “Decoding RNA Dynamics and DNA (De)methylation: One Cell at a Time”, 10th Macau Symposium on Biomedical Sciences 2024，2024年6月，澳门.

18. “新型单细胞基因组学技术研发及其在水产动物中的应用”，集美大学水产前沿讲座，2024年5月，福建厦门.

19. “新型单细胞基因组学技术研发及其在水产动物中的应用”，临沂大学学术报告，2024年5月，山东临沂.

20. “新型单细胞基因组学技术研发及其在水产动物中的应用”，农业农村部水生动物基因组学重点实验室学术讲座，2024年4月，北京.

21. “新型单细胞基因组学技术研发及其在水产动物中的应用”，中国水产科学研究院生物技术研究中心，2023年9月，线上.

22. “新型单细胞基因组学技术研发及其在心脑疾病中应用”，上海交通大学医学院全健康学院，2023年9月，上海.

23. “胚胎单细胞新生RNA代谢标记测序技术开发及应用”，第八届全国斑马鱼研究大会，2023年8月，山东青岛.

24. “高通量单细胞技术在水生动物病害研究上的应用”，中国水产学会鱼病专业委员会2023年学术年会，2023年7月，广东广州.

25. “新型单细胞基因组学技术研发及其在心脑疾病中应用”，中国科学院遗传与发育生物学研究所，2023年7月，北京.

26. “单细胞组学技术在鱼类生物学中的应用”，第二届单细胞技术及组学应用发展大会，2023年5月，上海.

27. “Temperature and the evolution of the fish immune system: insights from single-cell genomics”，第二届亚洲发育与比较免疫学大会，2023年5月，辽宁大连.

28. “高通量单细胞技术在鱼类生物学中的应用”，2022中国水产学会范蠡学术大会，2022年12月，线上.

29. “鱼什么都知道：单细胞组学技术在神经疾病中的应用”，临港实验室系列学术报告，2022年12月，上海.

30. “单细胞组学:解析复杂组织的异质性和RNA转录动力学”，中国科学院生物与化学交叉中心，2021年12月，上海.

实验室成员

实验室位于上海海洋大学海洋科技大楼1018

工作人员：黄松钱副教授、徐淑坦副教授、吴智超工程师、刘明丽博士后、产久林博士后

博士研究生：张晓雯博四、翟雪博四、李新闻博三、魏朝广博三、李晓龙博三（兰州大学联合培养）、程江博博三（兰州大学联合培养）、谢宏帅博二、张明皓博二、黄巧博二、严晨瑜博一、庞飞镖博一

硕士研究生：赵文欣硕三、占思瑶研三、朱江浩研三、王文婷研三、祁婧婷研三、范旭研二、马静雯研二、黄丹研二、赵颖研二、陈虹如研二、祖金杰研二、刘涵宇研一、汤昌儒研一、郭可君研一、左诗雨研一、汪秋建研一、宣文欣研一、陈雯婕研一、周益蜓研一、李绚研一

本科生：王天铭本四、姜宇昂本三、郝悦彤本三、李鑫阳本三、刘梓恒本二

Updated on 2025/12/22. Full publication list and news available at: www.hulabshou.cn